1. login เข้า Server Cisco Prime
2. ใช้คำสั่งหยุดการทำงานของ Cisco Prime โดยใช้คำสั่งว่า
# ncs stop
3. จากนั้นใช้คำสั่งในการลบไฟล์ Backup และไฟล์ tempolary
# ncs cleanup
จากนั้นจะมีเงือนไขยืนยันในการลบไฟล์ต่างๆ เสร็จแล้วก็รอจนกว่าจะลบเสร็จ
4. จากนันใช้คำสั่งให้ Cisco Prime ทำงานใหม่
# ncs start
หรือ restart server 1 ครั้ง
หรือ restart server 1 ครั้ง
ตรงนี้อาจจะใช้เวลานานหน่อย หลังจากเสร็จแล้ว สามารถใช้งาน Cisco Prime ได้ผ่านหน้าเว็บตามปกติ